Dans le petit monde de l’analyse quantifiée de la marche, les médecins prescripteurs reçoivent le rapport de l’examen sous plusieurs formes. Dans la majeure partie des cas, ce rapport se présente sous la forme d’un rapport électronique « Polygon ». Ce rapport est propriétaire, c’est à dire propre à Vicon Motion Systems, dont le matériel de capture de mouvement équipe la plus grosse majorité des salles d’analyse quantifiée de la marche. Ce rapport contient du texte, des images, des vidéos et des courbes graphiques. L’avantage d’utiliser un tel logiciel est bien souvent la possibilité de dérouler les courbes cycle de marche par cycle de marche, d’exploiter les modélisations musculo-squelettiques en 3D et de disposer de fonctions spécifiquement développée dans le cadre de l’examen clinique de la marche.  Bien souvent, du fait du poids des vidéos, ce rapport électronique est lourd et ne peut aisément être transmit autrement que par CD. On peut également le transmettre par internet via un serveur ftp mais il faut que celui-ci permette une sécurisation des données qui, dans ce cas, relèvent de l’information médicale.

Dans d’autres cas, le problème posé par ces rapports relève du stockage au sein même de la structure hospitalière. En effet, les services hospitaliers ne voient pas toujours d’un très bon oeil le stockage de rapports dont le poids oscille entre 150 et 300 mégas chacun. Parfois même ils n’acceptent tout simplement pas ce stockage pour des raisons de sécurité. En effet, le lanceur du rapport étant un exécutable, certains services informatiques hospitaliers n’acceptent pas le stockage in situ.

Dans le cadre du dossier patient informatisé, un tel rapport pose des problèmes d’intégration dans des logiciels de dossiers patients informatisés comme SanoCOM de 2CSI (qui entre nous est une grosse bouse) ou M2 de la société Moove (excellent, respectant le cahier des charges européen en matière de dossier patient informatisé). Cette intégration, dans le monde merveilleux de Candi, devrait consister en une encapsulation cryptée des données au sein du logiciel, ce qui est tout simplement impossible en terme de ressources concernant ces rapports Polygon.

En dernier lieu, ce type de rapport pose tout simplement problème quand aux compatibilités système. En premier lieu, il faut Microsoft Windows pour le lire. On peut le lire sous Mac ou Linux mais forcément en utilisant un logiciel de virtualisation qui de toute façon lancera Windows. J’en avais déjà parlé là. Je ne parle pas des difficultés que le lecteur du rapport aura s’il n’a pas les bons codecs vidéo pour lire les vidéos intégrées. A Bois-Larris nous nous affranchissons du problème en fournissant des vidéos au format mpeg1. Ainsi, le format étant nativement pris en charge par Windows, pas besoin d’installer des packs de codecs. Pour autant, en fonction de la version de Vicon Polygon qui a servi à élaborer le rapport, ce dernier devra être lu par un Windows spécifique. Ainsi, pour une version de Polygon 3.1 ou antérieure, aucun problème pour lancer le rapport sous Windows XP. Pour lire ce rapport sous Windows Vista/Seven, il faudra installer un patch.  Pour un rapport produit via Polygon 3.5 (le dernier en date), aucun problème pour lancer le rapport sous Windows Vista/Seven. Par-contre, pour lancer le rapport sous Windows XP, il faudra là encore un patch.

Bref, beaucoup de facteurs font que certaines équipes se tournent vers le rapport papier imprimé ou le rapport électronique pdf. Dans le cas du rapport papier, certains centres fournissent les courbes sur papier et donnent un CD contenant les vidéos. Ce n’est toutefois pas très pratique car on perd souvent l’un des deux. La longévité du support CD/DVD gravé, qui est très courte, n’incite pas vraiment à utiliser ce support sur le long terme.

Dans le cas du rapport pdf, il n’était ni plus ni moins que la version électronique du rapport papier. Depuis la version 8 Adobe a rendu possible l’intégration de fichiers multimédias tels que les vidéos. Ces vidéos peuvent être au format flv, mpeg, avi, mp4…Pour les intégrer dans le fichier prf il faut soit investir dans une version payante d’Adobe Acrobat, soit utiliser Latex, soit utiliser la seule solution logicielle gratuite et simple à mettre en oeuvre, Foxit Reader 5. Ci-dessous, un tutoriel vidéo pour insérer une vidéo dans un fichier pdf. Ce tutoriel est un vidéocast mensuel intitulé « On Refait La Marche ». Vous pourrez retrouver ce vidéocast tous les mois sur le site analysedelamarche.fr  ou sur la chaîne Youtube du site.

 

Un dernier point. Il existe de plus en plus de structures qui s’équipent d’une salle d’analyse de la marche. Ces salles disposent en général de caméscopes numériques ou non, d’une plate-forme de posturo parfois, d’un locomètre ou d’un tapis GaitRite au mieux. Il est tout à fait possible de produire un rapport pdf  avec les vidéos intégrées afin d’agréger l’ensemble des observations cliniques et des mesures en un seul document. Nul besoin alors de disposer de Vicon Polygon qui ne présente d’intérêt que pour les salles d’analyse quantifiée de la marche.

Pour que vous puissiez vous faire une idée précise des différences entre rapport Polygon et rapport pdf, nous mettons à votre disposition un rapport exemple pdf et un Polygon. Ces rapports sont accessibles sur cette page du site analysedelamarche.fr. Amusez-vous bien

 

 

UPDATE : Fabien Leboeuf, Docteur-Ingénieur en Biomécanique au Laboratoire d’Analyse de la Marche du CHU de Nantes nous propose un document expliquant la méthode et fournissant les codes pour l’utilisation de LaTeX dans l’élaboration de rapports d’analyse de la marche sous forme d’un document pdf unique. C’est publié dans The PracTeX Journal et c’est par ici.

 

Depuis plusieurs mois, on me questionne sur l’utilisation du système Vicon et de ses softs sur mac. Ce petit billet de fond va me permettre de répondre aux interrogations de chacun mais surtout de faire un point large sur ce qu’il est possible de faire ou non. Nous ne resterons pas uniquement sur l’écosystème Mac mais également sur les IDevices comme l’Ipad ou l’Iphone.

 

1. Les softs Vicon ne tournent que sous Microsoft Windows…

Voilà, ça c’est fait. Tout ça pour dire qu’il n’existe pas de logiciels Vicon programmés pour fonctionner sur Mac Os. Il va donc falloir utiliser d’autres biais pour faire tourner les softs sous Windows sur Mac. Pour cela, deux solutions Bootcamp ou un soft de virtualisation comme Parallels Desktop. La virtualisation consiste à faire tourner Windows à l’intérieur même de Mac Os X. Bootcamp est la solution Apple pour faire cohabiter Mac Os avec Windows ou l’inverse . Il suffit d’utiliser l’utilitaire Apple Bootcamp et de suivre pas à pas les indications pour installer un Windows tout propre dans sa petite partition dédiée. Deux problèmes se posent en fonction de la génération de mac que vous avez et de version de parallels desktop si vous souhaitez utiliser la virtualisation

- Que le logiciel de capture de mouvement Nexus voie le dongle.

- Faire le lien réseau entre Nexus et le système de capture de mouvement pour prendre la main sur la capture.

 

2. Utiliser Vicon Nexus sur Mac sous Windows

Que ce soit sous Bootcamp en redémarrant sous Windows (en pressant le bouton « alt » au démarrage) ou sous Parallels Desktop, le dongle est parfaitement reconnu et Nexus se lance sans problème. Quelques bémols toutefois.

Il n’y a aucun problème sous bootcamp et windows (XP ou Seven… Oubliez Vista) reconnait le dongle, que vous l’installiez avec les pilotes fournis par Vicon ou que vous laissiez Windows Update faire son boulot.

Sous parallels desktop en revanche, ça fonctionne uniquement si vous laissez Windows Update trouver les pilotes de votre dongle. Si vous installez les pilotes fournis par Vicon, ça ne marche pas. La raison est simple. Windows Update va chercher les derniers pilotes certifiés disponibles et les installer. Aladdin, qui fabrique les dongles, a récemment adapté ses pilotes pour qu’ils puissent fonctionner en environnement de virtualisation.

 

3. Capturer le mouvement sur Mac avec Vicon Motion Systems

Utiliser Vicon Nexus pour traiter et visualiser les fichiers c’est une chose, capturer le mouvement c’est autre chose. Il faut qu’il y ait la possibilité de faire le « link » avec la machine. Sous Nexus 1.6 comme 1.7, pas de problème le lien se fait mais à certaines conditions. Tout d’abord, il faut que l’adresse de votre carte réseau Ethernet soit 192.168.10.1. Si vous êtes sous parallels desktop, il faut paramétrer cette adresse sous windows mais également bien spécifier dans les options de parallels qu’il s’agit d’une carte ethernet. En fonction du chipset réseau et de la génération de votre mac cela peut ou non être nécessaire. Là je vous parle pour un Macbook Pro de 2009.

Vous constaterez que si vous faites le « link » avec le système, cela semble ne pas fonctionner. Sur mac, que ce soit sous bootcamp ou parallels desktop, le lien n’est pas réalisé en temps réel au contraire d’un PC classique. il y a une petite manip à faire qui consiste à faire un « refresh » comme montré sur l’image ci-dessous.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

C’est magique, ça fonctionne.

Attention toutefois. Je vous recommande vraiment de réaliser la capture de mouvement sous Bootcamp. En effet, en virtualisation ça fonctionne mais le principe même de virtualiser Windows sous Mac Os ponctionne beaucoup de ressources (mémoire et processeur). Si vous souhaitez utiliser vraiment la notion de temps réel, il est nécessaire d’avoir à sa disposition du maximum de ressources.

Tout cela a été testé sous un MacBook Pro 13 pouces de 2009 avec Mac Os Snow Leopard 10.6.8, Parallels Desktop 6.0.12090.660720 (la version précédente ayant des problèmes sous cette version de Snow Leopard) et Vicon Nexus 1.6.1 et 1.7.1.

 

Remarque n°1 : Mac Os Lion : Lion est sorti hier, uniquement disponible dans le Mac App Store pour l’instant. Attention, la peinture est fraiche. Cela veut dire que tout ce que je viens de vous raconter ne marche pas forcément. Attendez la version 1.7.3 environ avant de l’installer sur une machine de production. Parallels Desktop au lancement signale actuellement que seule la version citée plus haut fonctionne avec Lion.

Remarque n°2 : Polygon, Nexus, Pecs, Bodybuilder tournent maintenant sans problème sous Microsoft Windows 64 bits. Je vous recommande fortement d’installer un Windows 64 sur votre partition Bootcamp pour tirer parti du processeur 64 bits des Mac actuels mais surtout de profiter de la totalité de la mémoire vive disponible, ces applications étant gourmandes en ressources.

 

4. Les rapports d’analyse de la marche sous Polygon

Pour les ingénieurs d’analyse de la marche (terme impropre dans pas mal de cas mais je n’en ai pas d’autres), la production d’un rapport Polygon est faisable sous Mac dans les mêmes conditions que décrites dans cet article.

Pour le médecin qui reçoit le rapport, celui-ci pourra être lu sous Mac soit via Bootcamp, soit Parallels Desktop. Dans le premier cas, sous Bootcamp, aucun problème. Il s’agit d’un ordinateur sous Windows, tout fonctionne donc très bien. Quelques remarques cependant. Si le rapport fourni a été réalisé sous Vicon Polygon 3.1, le rapport en lui-même ne pourra être lu que sous Windows XP. Pour être lu sous Windows Vista (beurk) ou Seven, il faudra installer un patch disponible à cette adresse. Si le rapport a été réalisé sous Vicon Polygon 3.5, le rapport fourni ne pourra être lu que sous Windows Vista/Seven… Va comprendre Charles….

Sous Parallels Desktop en revanche, les choses se compliquent. La lecture de l’AQM est possible dans un environnement de virtualisation. Les courbes et vidéos passent sans problème. La modélisation 3D en revanche pose d’autres problèmes. La visualisation du Kinégramme 3D peut faire planter le rapport Polygon si l’accélération graphique est cochée dans les paramètres de Parallels Desktop. Il faut donc vérifier que cette accélération graphique soit décochée si on veut visualiser la modélisation. Bien sûr, au cas où cette option est désactivée, l’interface Aero de Windows sera désactivée également.

 

5. Les Idevices avec Vicon

Dans le cadre de la mise en place d’un laboratoire d’analyse de la marche, on m’a demandé quelle était la meilleure façon pour monitorer un signal EMG dans une autre pièce avec le système EMG Cometa Wave (anciennement ZeroWire d’Aurion). La solution à mon sens la plus pratique consiste à utiliser un Ipad (ou un Iphone mais c’est moins grand) pour prendre la main sur le PC principal d’acquisition. J’ai fait il y a quelques semaines une vidéo pour présenter à la fois le monitoring, mais également la prise de contrôle des appareils en question (capture de mouvement, piste de marche électronique, EMG….). Je vous mets la vidéo ci-dessous :

 

L’avantage avec ce type de système c’est qu’il ne coûte pas bien cher au regard des prix pratiqués par les constructeur pour des solutions de monitoring dédiées. Un Ipad (environs 500 euros) + une app type Idisplay à 3,40 euros et le tour est joué.

Il existe des applis de contrôle à distance pour mac et pc sous ipad. Globalement, ces apps sont assez mauvaises et peuvent être vendues cher. Le problème réside principalement, quand ça marche, au taux de rafraichissement de l’écran. La prise de contrôle nécessite de dégrader fortement le framerate et ainsi, dans le cas du monitoring, on se retrouve assez facilement avec un slide show : inutilisable. IDisplay est une app intéressante dans le sens où elle n’est qu’une  extension d’écran. Votre Ipad se transforme en écran supplémentaire via un petit soft serveur sur le PC dont vous voulez prendre le contrôle. Comme vous pouvez le voir sur la vidéo, le framerate est satisfaisant et permet d’avoir une visualisation du signal EMG tout à fait exploitable sans temps de latence gênant. Il vous suffit ainsi de déplacer la fenêtre de votre soft EMG ou d’une fenêtre Nexus vers votre Ipad et le tour est joué. Gros avantage de IDisplay, il gère le multitouch et donc permet d’interagir avec le doigt comme avec une souris. Ca marche très bien. Ceux qui réalisent des AQM chez les enfants ou les personnes agées verront très bien à quoi cela peut leur servir

Gros mois de mars 2011 chez Vicon Motion Systems. Le spécialiste de la capture de mouvement vient de sortir les caméras T série S. Ces caméras ont le bon goût de proposer une possibilité révolutionnaire dans le domaine de la motion capture : la capture de mouvement en extérieur. Ca y est, fini les tracas de l’installation en salle obscure. Avec ou sans fenêtres, vous pouvez dès à présent capturer le mouvement avec un maximum de performance. Ayant travaillé quelques années à l’Institut National du Sport et de l’Education Physique, je vois très bien l’application que l’on peut tirer de ces nouvelles caméras. Des T40 S permettront d’enregistrer les sportifs dans leur élément, à savoir leur piste d’athlétisme par exemple, plutôt que dans une salle obscure bien éloignée de leur terrain de jeu habituel. Dans le domaine clinique, l’avantage est mois clair. Toutefois, outre le fait de simplifier les conditions environnementales de l’installation, on peut imaginer de la capture en extérieur avec de l’analyse de la marche sur

différents terrains.

Côté logiciel, Vicon Nexus 1.7 sort ce mois-ci. Attendez donc toujours les retours des early adopters qui ne vont pas manquer d’être confrontés aux bugs restant qui peuvent être gênant en environnement clinique. Les nouveautés concernent surtout une amélioration de la prise en charge des caméras Basler et des systèmes EMG Noraxon. La nouveauté principale réside dans l’intégration des outils Ergoneers Dikablis Eye Tracking Solution. Il s’agit d’outils permettant le tracking occulaire. Dans les laboratoires de recherche investigant dans le domaine du couplage perception / action, ces systèmes permettent d’obtenir la direction de la tête et du regard. Je parlais de l’INSEP plus haut, je pense que mon ami J-F Stein, responsable du Labo Mouvement, Action et Performance, verrait d’un « bon oeil » ce type de matériel dans son arsenal de recherche.

 

 

Enfin, au rayon des bonnes nouvelles toujours, Bodybuilder et Pecs sont enfin compatibles Windows 7.

Vicon Motion Systems sort une version majeure de Vicon Nexus, la version 1.6. Ce logiciel permet d’exploiter les systèmes de capture de mouvement optoélectroniques du constructeur sur le versant ingéniérie / biomédical/ science. Une des principales innovations est le support plein et entier de Microsoft Windows 7. D’autres nouveautés sont également les bienvenues : nouveaux outils de labelling, l’intégration d’un filtre butterworth, des améliorations concernant les graphes affichés dans le logiciel, la possibilité d’ajouter des paramètres dans le modèle biomécanique, le support des EMG Noraxon (via connexion USB), améliorations globales de performance…
C’est du tout bon mais comme d’habitude dans ce type de soft, ce qui fonctionnait pour une version antérieure peut ne pas fonctionner dans cette version. Pour cela, avant de passer à Nexus 1.6, il faut faire la liste des nouveaux problèmes rencontrés. Ainsi, pour les assidus de l’utilisation de PECS, le passage à la nouvelle version risque de poser de sérieux problèmes. PECS ne fonctionne pas avec Windows 7, que ce soit en 32 ou 64 bits. PECS ne fonctionne, dixit Vicon, qu’avec Windows XP 32 Bits. Ils travaillent à la résolution du problème. Toutefois, même sur un XP 32 bits, certains scripts ne fonctionnent plus alors qu’ils fonctionnaient avec la version précédente 1.5.2 (notamment la feuille de calcul du Gait Deviation Index pour les ingénieurs d’analyse de la marche).

En règle générale, ne jamais installer une nouvelle version tant que les plâtres n’ont pas été essuyés. Il est tout à fait possible avec cette version d’installer Nexus 1.6 conjointement avec la version 1.5.2. C’est une opération que je vous conseille bien que cela ne soit pas recommandé particulièrement par Vicon.

MISE A JOUR : Une heure après la publication de ce billet et quelques Tweets, Vicon a retiré Nexus 1.6 du téléchargement. Peut-être pas de relation de cause à effet, mais en tout cas, ya du bug !!!

Dans les différentes formations sur l’analyse de la marche, je croise un grand nombre de personnes désireuses de se doter d’outils simples, accessibles et pas chers leur permettant de faire une analyse succinte de la marche. Bien évidement, tout le monde ne peut pas se permettre d’investir plusieurs centaines de milliers d’euros dans la création d’une plate-forme d’analyse de la marche. Deux caméras vidéo et un logiciel adapté suffisent dans un premier temps pour observer, via une grille de lecture adéquate, l’évolution de la marche d’un patient. Il est judicieux de disposer d’un logiciel permettant d’analyser la vidéo, de tracer des angles, de mesurer des distances, de mettre des annotations, de synchroniser plusieurs vidéos (lorsque l’on a deux sources vidéo), de comparer la vidéo d’avant avec celle d’après. Toutefois ces logiciels sont vendus chers. La solution pour ceux qui n’ont pas beaucoup de sous : Kinovea, programmé par Joan Charmant.

C’est un logiciel libre et opensource (GPL 2)  GRATUIT, puissant, facile d’utilisation, véritable alternative à de nombreux logiciels payants. Les fonctionnalités sont utiles à la fois aux spécialistes des sciences du mouvement comme aux personnes travaillant en clinique (kinésithérapeutes, ergothérapeutes…). Je vous laisse découvrir ce petit bijou à télécharger sans modération et à faire connaître autour de vous. Des initiatives de cette qualité, on ne peut qu’y souscrire.

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